动物科学学院的前身--畜牧教研组、兽医教研组在1958年建校时就已存在；1980年以畜牧教研组、兽医教研组为骨干成立畜牧兽医系；1998年由动科系、生物基础部的遗传、生理生化、动物学教研室和园艺系的蚕桑专业合并组建成动物科技学院，2008年更名为动物科学学院。

经过60年的发展，目前学院共有教职员工88人，其中专任教师67人。专任教师中，具有博士学位24人，硕士及以上学位教师占比95％；学缘异缘率达88.3%；职称结构上，有教授15人，副教授38人，高级职称教师占80%，讲师12人；11名教辅人员中，正高级实验师1名，高级实验师6名。教育部新世纪优秀人才1人，兵团中青年科技创新领军人才2人，兵团英才第二层次人才1人、第三层次人才2人，兵团学术技术带头人1人，自治区2016年教学能手1人，自治区开发建设新疆奖章获得者1人，兵团优秀科技特派员4人，兵团青年科技奖获得者1人，全国优秀科技工作者1人，全国农村科普先进个人1人。

学院现有动物医学、动物科学、水产养殖学和草业科学4个本科专业和畜牧与兽医、动物防疫与检疫两个专科专业，在校学生1300余人，其中本科生1285人。秉承培养“用得上、留得住、干得好、堪重任”的生产一线实用人才，自建校至今，累计培养各类毕业生6200多人。学院现有1个国家级实验教学示范中心（动物医学国家级实验教学示范中心），1个兵团重点实验室（塔里木畜牧科技兵团重点实验室），1个兵团级工程中心（南疆畜禽疫病防治工程中心），1个校级重点实验室（南疆畜禽疫病诊断重点实验室）及8个一级本科教学实验室，总面积逾6300m2，一个占地20余亩、使用面积13000m2的校内综合试验站；校外实践教学基地22个。学院现有1个兵团重点学科（动物营养与饲料科学），1个自治区重点扶持学科（兽医学），2个校级重点建设学科（预防兽医学和动物遗传育种与繁殖），畜牧学为一级硕士学位授权点，水生生物学为二级硕士学位授权点，兽医学为专业硕士学位授权点。1个农业部认定的技能鉴定中心，1个校级实验教学示范中心（动物科学实验教学中心），兵团精品课程3门，校精品课程2门、精品视频公开课2门，校“十三五”重点建设课程9门。

近5年，学院累计科研立项170项，其中国家自然基金36项，省部级项目30项，其他各级各类项目104项，立项经费2810.8万元。目前学院共承担在研项目98项。获得各类科技进步奖15项，其中兵团科技进步奖4项，出版学术专著11部，发表学术论文500余篇，其中四大检索论文38篇。获得个人荣誉4项，其中国家级1项，省部级3项；获得授权专利60项。学院结合兵团科技特派员制度，成立了专门的科技服务团队，在新疆尤其是南疆开展了卓有成效的科技服务，5年来在南疆四地州累计有1500余人次外出进行科技服务，26人被聘为科技特派员，科技特派员项目立项13项，受众达15000余人。5年来共培训入党积极分子704人次，发展党员150人，其中学生党员149人。目前学生党员比例达3.5%。涌现出一大批先进基层党组织、优秀共产党员和党务工作者。